腾讯系“云深智药”:用AI助力新药研发
发布时间：2020-07-09 发布者：亚时财经
对于任何一个新事物的研发，最难的都是让其从无到有，药品的研发也不例外。特效新药面世，其价格大多不会便宜，这主要是其研发成本居高不下。有数据显示，传统药物研发一般需要超过15年，耗资30多亿美元，并且还有很多已知疾病无药可治。近日，腾讯发布首个AI驱动的药物发现平台“云深智药（iDrug）”来帮助节约新药研发的时间与成本。
（图源：企鹅号“造就”）
据腾讯方面介绍，“云深智药” 整合了腾讯AI Lab和腾讯云在前沿算法、优化数据库以及计算资源上的优势，提供覆盖临床前新药发现流程的五大模块，包括蛋白质结构预测、虚拟筛选、分子设计/优化等。目前平台上已经运行十个左右研发项目，包括对抗新冠病毒药物的虚拟筛选和性质预测。
其中，腾讯AI Lab自研的预测蛋白质结构的算法在2020年加入世界最权威测试平台CAMEO，与35支顶级学界与企业队测试竞赛，腾讯比分大幅超越，半年内五次夺得月度冠军，领先众多国际知名研究团队。这款自研算法在困难案例（hard）上的提高非常显著，比业内公认的权威方法Robetta提高了10%。
在药物虚拟筛选和ADMET性质预测上，AI Lab也通过自研算法，在多个公开数据集上取得了较高精确度、突破了业界标准。
据悉，CAMEO作为全球唯一的蛋白质结构预测自动评估平台，自2012年上线以来收集了全球最顶级、应用最广的自动化蛋白结构预测服务器，成为最权威的蛋白质结构预测服务器的评判标准。目前竞赛团队包括了来自华盛顿大学、有「蛋白设计天才」之称的David Baker教授团队，来自密歇根大学，曾夺得蛋白结构预测CASP六连冠的Yang Zhang（张阳）教授团队等。
此外，腾讯方面表示，“云深智药”平台的虚拟筛选和ADMET性质预测两个工具模块已开放免费使用，蛋白质结构预测、分子设计/优化、合成路线规划等模块将陆续在年内上线。并且ADMET预测模块即将开源大规模自监督分子图预训练GX模型，分子生成模型预计也将在下半年开源。
据了解，临床前新药发现的流程为：靶点的发现和验证，苗头化合物的发现，先导化合物的发现和优化直至临床候选化合物的确认及开发。“云深智药” 能全面覆盖临床前新药发现的全流程，更好的帮助研究人员进行新药研发。
该平台在新药研发流程中有许多优势：例如其蛋白质结构预测方法在准确度上达到国际领先水平；通过AI和深度神经网络算法来提高目标靶点的模型预测精度；ADMET属性预测模块已在多个数据集上比学术界现有最好模型提高3%~11%。
另外，该平台还提供算力和数据库的一体化服务支撑。数据方面，平台使用的分子大数据，基于现有公开数据集，进行了多个环节的精细清洗整理工作，得到可以用于直接构建深度学习模型的药物分子大数据集；算力方面，腾讯云为云深智药平台提供数据库服务，药企、科研机构登录平台即可开展研究，不需要再自行部署计算资源。
腾讯方面表示，药企、科研机构等不仅能够免费试用平台搭载的核心功能，也可以和腾讯共同开发定制化的AI工具。目前已经和多家药企达成合作、将AI模型应用到实际药物研发项目中。
责任编辑：Carrick
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