最强癌基因被发现:竟不在染色体上
发布时间:2019-12-03 发布者:亚时财经
在癌症治疗的历程中,有三次重大变革,分别是化疗、靶向疗法和免疫疗法。如今,随着一篇nature论文的发表,兴起了第四次变革的说法。这一次的对象是染色体外DNA (ecDNA)。
(图源:网络)
虽然上世纪60年代便有人发现了这种环状DNA的存在,也知道它会携带癌基因;但从前没人直接观察过ecDNA、没人指出它对肿瘤的生长有多关键。
Nature发布的新研究中,科学家终于首次直接观察了ecDNA (不止基因测序),他们发现:ecDNA上的癌基因,是肿瘤的整个基因转录组当中,表达水平最高的那部分基因。而染色体上癌基因的表达相对较低。
nature文章截图(图源:量子位)
ecDNA上的癌基因之所以比染色体上的癌基因更能发挥作用,主要是因为不像染色体那样受到严格保护,它更容易读取,能快速扩增,具有侵略性。
研究成果来自路德维希癌症研究所(Ludwig Cancer Institute)和加州大学圣地亚哥分校,论文的一作是位名叫吴思涵的华人学者。
据量子位报道,ecDNA不是原本就长在染色体之外,而是在细胞有丝分裂中期,从染色体上脱落下来成环的DNA分子,常常带有癌基因。这是已有的研究成果。科学家们大多是依靠基因测序,来观察DNA里的癌基因,却忽略了基因的物理位置,在癌症中的意义。
于是,该实验团队把亚显微结构成像(Ultrastructrual Imaging)、光学匹配(Optical Mapping)、全基因组测序(WGS)等等搭配在一起,清晰展现出了环状DNA的形态。在了解结构的同时,也可以发现ecDNA上普遍带有癌基因。
研究还发现,ecDNA能产生大量的副本,不同细胞之间,ecDNA含量差异巨大,副本越多差异越大。肿瘤细胞有了充足的多样性,便能更好地应对环境变化。也就是说,多样性可以支持肿瘤快速进化,产生抗药性,这也是晚期癌症难治的原因之一。
同时,实验证明,癌细胞里表达水平更高的那些癌基因,就是来自ecDNA身上的癌基因。比起染色体上的癌基因,ecDNA上的癌基因有更强的力量,推动癌症病情向前发展。为什么ecDNA是从染色体上分离出来的,却比染色体的癌基因表达强很多?研究人员表示,这是因为ecDNA的开放性比染色体要强很多。
这种开放性的主要原因有两点。一是ecDNA表面缺少抑制转录的组蛋白修饰,也就是说它的转录不会被抑制。而染色体DNA上的基因转录一般是被抑制的;二是ecDNA作为一种环状DNA,没有染色体的那种高级压缩结构。这会使得基因的转录变得容易。
虽然ecDNA到底是怎样大规模复制的,研究团队也还在进一步研究中,但目前的成果已经带来一种启发:我们不要只盯着染色体上的癌基因,环状的ecDNA也可能带我们找到新的癌症治疗方法。
论文的第一作者吴思涵也在网上回答了一些人们关心的问题。他说道,关于ecDNA和肿瘤转移的关系正在进一步研究当中,或许在下一篇文章中就会有结果。对于ecDNA的形成,他表示很多数据都指向其形成与DNA损伤有关,尤其是DNA双链的断开。同时他也强调ecDNA可以被试剂“消除”,但一旦停止用药,又会死灰复燃。
论文第一作者吴思涵 (图源:量子位)
这项研究是癌细胞领域一个进步,期待后续研究为癌症的治疗做出更大贡献。
亚洲时报 综合
责任编辑:杨志杰